9月23日，卫生部、解放军总后卫生部以联合公告的形式，发布了国家 重大新药创制 科技重大专项 十一五 计划第二批课题申报信息。
本批课题是该重大专项 十一五 计划第一批课题申报指南内未启动的部分。具体包括：全部启动 新药研究开发关键技术研究 项目，部分启动 创新药物研究开发 、 创新药物研究开发技术平台建设 和 企业创新药物孵化基地建设 3个项目。至此，本专项 十一五 计划内容已全面启动实施。
创新药物研究开发项目针对恶性肿瘤、心脑血管疾病、神经退行性疾病、糖尿病、精神性疾病、自身免疫性疾病、耐药性病原菌感染、肺结核、病毒感染性疾病等10类（种）严重危害人民健康的重大疾病，自主研制一批化学药物、现代中药和生物技术新药。该项目下设 新药临床研究 、 新药临床前研究 、 候选药物研究 三项专题，本批启动 新药临床前研究 、 候选药物研究 两项专题。
创新药物研究开发技术平台建设项目，本批启动综合性新药研究开发技术大平台、专业性新药研发技术平台，包括药物筛选及相关技术平台、新药临床前药效学评价技术平台、临床前药物代谢动力学技术平台、生物技术新药中试放大及分离纯化技术平台、生物技术药物质量标准和质量控制技术平台、中药标准研究平台、新药研发信息化技术平台、新制剂与新释药系统技术平台、中药新药发现和评价技术平台，以及以企业为主的药物开发技术平台等三类11项平台建设专题。
企业创新药物孵化基地建设项目，旨在通过政府引导、产学研结合，在条件具备的企业建设以企业为主体的创新药物孵化基地，促进企业提升药物技术创新能力，推动产业发展。本批课题限于支持具有前沿技术的创新型中小生物技术公司的发展，充分发挥其创新活力和成果转化能力。
新药研究开发关键技术研究项目针对化学药、中药和生物技术药新药研究开发、药物大品种技术改造和新药产业化发展的关键环节，重点攻克严重制约发展的瓶颈技术。通过专项的实施，力争突破20～30项制约创新药物研究开发的关键技术，加速新药创制的进程，有力推动创新药物研究开发及产业化水平。该项目下设 化学药物研究关键技术 、 中药研究关键技术 、 生物技术药物研究关键技术 和 药物大品种技术改造关键技术 四项专题。
